重庆南开中学坚持全面推进素质教育，不断提高教育质量。自20世纪80年代开始★★，南开中学就率先以课程设置改革为突破口★★，探索学校内涵发展★★、特色建设的新途径★。目前学校已经建立起了有南开特色的必修课－选修课－自修课和学科课程－活动课程－隐性课程有机结合★、相互补充的课程体系。南开中学每学期开设40余门选修课，特色活动课程“南开讲坛”邀请了中科大校长朱清时★、香港理工大学校长潘宗光，以及北大、清华★、人大、南京大学等著名高校的院士、教授、学者前来演讲★★★，每周一讲★，已逾230讲★★，并正式出版了《南开大讲堂》第一辑★★★、第二辑。

　　年，是著名爱国教育家张伯苓先生创办的南开系列学校之一★★★。南开学校肇始于天津。张伯苓原为北洋水师见习军官★，目睹了甲午战败后★★★“国帜三易”的悲愤一幕，立志教育救国★★★。年创办南开经济研究所。“九一八★★”事变后，华北形势危急。为了保证教育工作不因时局变化而中断，并实现将南开学校办到全国各地的理想，张伯苓校长决定在四川建中学，选址重庆沙坪坝。学校初名南渝中学，取南开在渝办学之意。年，天津南开中学和南开大学被日机炸毁，★“为了表示南开生命之延续★★，以及不屈之决心”，张伯苓校长在校董会的建议下，于年，重庆三中恢复南开校名，并由题写了校牌。目前★，学校是直属重庆市教委管理的公办高完中★★、重庆市重点中学。

　　建校79年来★，学校先后为社会输送了6万余名祖国各个领域的骨干★★★。他们中有20余位国家和省部级领导，有33位院士★★，有将军、教授、艺术家和经济学家等。国家领导人，中国科学院院长周光召，中国工程院院长朱光亚★★，国家自然科学基金会主任张存浩★，著名科学家邹承鲁，著名经济学家吴敬琏、茅于轼★★★，著名理论家郑必坚，著名词作家阎肃，南极科学考察队队长颜其德，“大爱铸忠魂”的中华信仰楷模冯理达★★，中华骨髓库跨国捐髓第一人吴渝，抗震救灾中“最美的微笑”盛于峰，2009年感动重庆十大人物庹蓝兰，2013年中国最美村官秦玥飞等人都是重庆南开中学的校友。

　　自建校以来★★★，重庆南开中学就因爱国和教学质量高而闻名★★★。抗战期间，、周恩来、华莱士等政要多次光临南开中学，重庆南开是抗战时期中国基础教育的典范。

　　学校的体育、艺术、科技活动丰富多彩，成果突出★★★。女子篮球★、田径★★★、排球、足球★★、网球、板球★★★、棒球★★★、高尔夫球★、乒乓球、跆拳道★★★、国际象棋等运动队，在各种竞技中屡创佳绩★★★。艺术方面，合唱、民乐★、管乐、舞蹈等团队有着很高的表演水平★★★，多次获奖★★。科技活动丰富多彩★★，2005年以来，3人荣获中国青少年科技创新奖，21人获得重庆市青少年科技创新市长奖或市长奖提名奖★★，60余人次获国家级科技创新奖项★★★，近500名学生在各种科技比赛中获得奖励，南开中学秉持“允公允能★★★，日新月异”的校训，坚持以培养高层次、高素质、创新型人才为方向，使学生既全面发展，又学有特长。多年来★★★，重庆南开中学的重点大学升学率都遥居全市榜首★。1997年重庆直辖以来，南开中学有759名学生考入北京大学、清华大学★★★，4000余名学生考取了★★★“985”重点大学★。由于出色的办学业绩，重庆南开中学被誉为“中学里的大学”和★“办中学的一面镜子”。

　　面临着新的历史机遇，学校按照“十二五”发展规划，着力实施“名师工程”、“栋梁工程”和“美丽校园工程”★★★，努力实现现代化办学和国际化发展★★★，正朝国内一流、国外知名、渐近国际水准的高水平示范性中学目标前进。